RNA结(jié)构分析(FlexNovo)是(shì)模拟配体预测和停靠的活动站点上下文中的(de)大片段FlexNovo 是(shì)一个简(jiǎn)单和容易使(shǐ)用的命令行实用工具,它使您能够轻(qīng)松地分析结(jié)构图(tú)案和蛋白(bái)的 RNA。FlexNovo 基(jī)于 FlexX 技术,是一种分(fèn)子的RNA结构分(fèn)析实用(yòng)程序,使(shǐ)您(nín)能够查看的片段,演(yǎn)变(biàn)以及化学配体的理化和几何属性。
它使您(nín)能(néng)够轻松地分析(xī)结构图(tú)案和(hé)蛋白的(de) RNA。FlexNovo 基于 FlexX 技术,是一种分(fèn)子的RNA结(jié)构(gòu)分析实用(yòng)程序,使您能够查看(kàn)的片段,演变以及化学(xué)配体(tǐ)的(de)理化和几何(hé)属(shǔ)性。
1、原始数(shù)据产出统(tǒng)计
2、过滤掉低质量reads后的数(shù)据统(tǒng)计(jì)
3、高级(jí)生(shēng)物信息(xī)分析结(jié)果(guǒ)报告。
RNA结构分析(FlexNovo)是(shì)利(lì)用(yòng)Trinity (Version: r2011-08-20) 进(jìn)行de novo assembly, Trinity参(cān)数:--min_kmer_cov 2 -- min_contig_length 100 --run_butterfly。拼接后的转录本,通过PERL脚本去冗余(yú),在同一个component ID的序列中(zhōng)选择最长的一(yī)个isoform代(dài)表该locus的(de)转录本,得到(dào)Unigene集。
