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RNA结构分析(FlexNovo)

软(ruǎn)件类(lèi)型:
国产软件
软件语言:
英文(wén)
软件大小:
20 MB
软件授权:
免费(fèi)软件
软件评(píng)级:
4
更新时间(jiān):
2017-05-22
应用平台(tái):
WinXP, Win7, WinAll
软件简介(jiè)

RNA结(jié)构分析(FlexNovo)是(shì)模拟配体预测和停靠的活动站点上下文中的(de)大片段FlexNovo 是(shì)一个简(jiǎn)单和容易使(shǐ)用的命令行实用工具,它使您能够轻(qīng)松地分析结(jié)构图(tú)案和蛋白(bái)的 RNA。FlexNovo 基(jī)于 FlexX 技术,是一种分(fèn)子的RNA结构分(fèn)析实用(yòng)程序,使(shǐ)您(nín)能够查看的片段,演(yǎn)变(biàn)以及化学配体的理化和几何属性。u2z红软基地

软件功能

它使您(nín)能(néng)够轻松地分析(xī)结构图(tú)案和(hé)蛋白的(de) RNA。FlexNovo 基于 FlexX 技术,是一种分(fèn)子的RNA结(jié)构(gòu)分析实用(yòng)程序,使您能够查看(kàn)的片段,演变以及化学(xué)配体(tǐ)的(de)理化和几何(hé)属(shǔ)性。u2z红软基地

软件(jiàn)特色

1、原始数(shù)据产出统(tǒng)计u2z红软(ruǎn)基地(dì)
2、过滤掉低质量reads后的数(shù)据统(tǒng)计(jì)u2z红软基地
3、高级(jí)生(shēng)物信息(xī)分析结(jié)果(guǒ)报告。u2z红软基地

软件说(shuō)明

RNA结构分析(FlexNovo)是(shì)利(lì)用(yòng)Trinity (Version: r2011-08-20) 进(jìn)行de novo assembly, Trinity参(cān)数:--min_kmer_cov 2 -- min_contig_length 100 --run_butterfly。拼接后的转录本,通过PERL脚本去冗余(yú),在同一个component ID的序列中(zhōng)选择最长的一(yī)个isoform代(dài)表该locus的(de)转录本,得到(dào)Unigene集。u2z红(hóng)软(ruǎn)基地

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