分子三维建模显示软件BALLView是时下互联网常用的教育教(jiāo)学软(ruǎn)件之一(yī),该软(ruǎn)件纯绿色免费无毒,请放心使用(yòng)。体积(jī)小(xiǎo),但功能强(qiáng)大。界面非常清爽(shuǎng),简单易操作。
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本文针对生物(wù)信息学中的分子三维(wéi)结构显示软件的建模问题(tí)进行了分(fèn)析和研究 ,介绍(shào)了Java3D技术中关于场景图等(děng)概念以及基于Web的(de)可(kě)视化系统的(de)分(fèn)析(xī)和设计(jì)方法(fǎ)。在此基础(chǔ)上 ,我(wǒ)们详细讨论了分子的几何模(mó)型和运(yùn)动模型 ,提出了一(yī)种基(jī)于Java3D的交互式分子三维结构(gòu)显示软件的(de)建模方法。最后 ,在相应软件系统HJMV的实现中 ,给出(chū)了(le)几(jǐ)种提(tí)高(gāo)该(gāi)软件运行速度的方法。
分子是物质中能够独立存(cún)在的相对稳定并保持该(gāi)物质物(wù)理化学特性的最小单元(yuán)。分子(zǐ)由原子构成(chéng),原子(zǐ)通过一定的作用力,以一定(dìng)的次序和排(pái)列(liè)方式结合成分子(zǐ)。以水(shuǐ)分子(zǐ)为例,将(jiāng)水(shuǐ)不断分离(lí)下(xià)去,直至不破坏水的特性,这时出(chū)现的最(zuì)小单(dān)元是由两个氢原子和(hé)一个氧原子构成的一个水(shuǐ)分子(zǐ)(H2O)。一个(gè)水分子可用电(diàn)解法或其他方法再分为两个氢原子和一个氧原子,但(dàn)这时它(tā)的特性(xìng)已(yǐ)和水完全不同了(le)。有(yǒu)的分子只(zhī)由一个原子构成,称单原子分子,如氦和氩(yà)等分(fèn)子属此(cǐ)类(lèi),这种单原子(zǐ)分子既是原子又是分子。由两个原(yuán)子(zǐ)构成的分子称双原子分子,例(lì)如氧分子(zǐ)(O2)和一氧化碳分子(zǐ)(CO):一(yī)个氧分子由(yóu)两个氧(yǎng)原子(zǐ)构(gòu)成,为同核双原(yuán)子分子;一个一氧化碳分子由一个氧原子和一个碳原子构成(chéng),为异核双原(yuán)子(zǐ)分子。由两个以上的原子组成(chéng)的分子统称多原(yuán)子分子。分子中的(de)原子数可为几个(gè)、十几个、几十个乃至(zhì)成(chéng)千上万个(gè)。例如一个(gè)二氧化碳分子(zǐ)(CO2)由一(yī)个碳原子和两个氧原子构(gòu)成。一个苯分子包含(hán)六(liù)个碳原子和六个氢原子(C6H6),一个(gè)分子包(bāo)含几百个原子,其(qí)分子式为C257H383N65O77S6。
