染（rǎn）色体（tǐ）距离大小测算(NucType)是一个（gè）方便（biàn）的应用，需要衡量和（hé）比较染（rǎn）色（sè）体或染色体的生物学家设计。 您（nín）可以使用应用（yòng）程序，以便测量两点之间的距（jù）离（lí）。该方案还可以分析染色（sè）体核型不对称指数（shù）从加载的图像文件或一个以（yǐ）前保（bǎo）存的项目。
1）已组装到（dào）contig或者（zhě）scaffold水平（píng）的基因（yīn）组，无论（lùn）是Sanger测序、二（èr）代（dài）测序（xù）或者三（sān）代测序完（wán）成（chéng）的基因组，但是未组装到染色体水（shuǐ）平均可。
2）基因组未知物种，Hi-C与常规de novo结（jié）合提高基因组组装（zhuāng）水平（píng）。
Hi-C之所以（yǐ）能用于基因组（zǔ）组装，是基于染色（sè）质（zhì）片段间（jiān）的交互强（qiáng）度呈现（xiàn）出随距离衰减的规律 Hi-C相互作用强度与距离关系
与遗传定律（lǜ）类似，这一规律可以用来判（pàn）断scaffolds的分类及相邻关系（xì）。分以（yǐ）下三步（bù）：聚类—排序—定向（cluster-order-orient）。
染（rǎn）色体（tǐ）（Chromosome ）是细胞内（nèi）具有遗传（chuán）性质的（de）物（wù）体，易被碱性染料（liào）染成深（shēn）色，所以叫染色体（染色（sè）质）；染色体是细胞（bāo）核（hé）中载有遗传信息（基因）的物质（zhì），在（zài）显微镜（jìng）下呈（chéng）圆（yuán）柱状（zhuàng）或（huò）杆状（zhuàng），主（zhǔ）要由脱氧核糖核酸和蛋白质组成，在细胞发生有丝分裂时期容易被碱性染料（例如（rú）龙胆紫和醋（cù）酸洋红）着色，因此（cǐ）而得名。
