Warning: mkdir(): No space left on device in /www/wwwroot/jx.baidu.com/func.php on line 159

Warning: file_put_contents(./web/hch368.com/cache/c4/58720/ac9cd.html): failed to open stream: No such file or directory in /www/wwwroot/jx.baidu.com/func.php on line 149
GG扑克 " />

GG扑克




  • 红(hóng)软基(jī)地:您身边最放心的安全(quán)下载站!
您所在的位置:首(shǒu)页 > 软件 > 应(yīng)用软件 > 教育(yù)学习 > MethMarker(DNA甲基化检测)

MethMarker(DNA甲基化检测)

软件类(lèi)型:
国产软件
软件语言(yán):
英文(wén)
软件(jiàn)大小:
25 MB
软件(jiàn)授权:
免费软件
软件评级:
4
更新时间:
2017-05-22
应(yīng)用平台:
WinXP, Win7, WinAll
软件简介

MethMarker(DNA甲基化检(jiǎn)测),提到遗传,我们都已(yǐ)经习惯于这(zhè)样的概念,即基因(yīn)组的编码信息存在于ACGT这(zhè)四(sì)种碱基的排列(liè)顺序中(zhōng)。L1e红软基地

软(ruǎn)件介绍

DNA甲(jiǎ)基化是最早发现的基因表(biǎo)观(guān)修饰方式之一,真核生物(wù)中(zhōng)的甲基(jī)化(huà)仅发生于胞嘧啶,即在DNA甲基化转移酶(DNMTs)的作用下使CpG二核(hé)苷酸5’-端的胞嘧啶转变为5’-甲(jiǎ)基(jī)胞嘧啶。DNA甲基化通常抑制基因表达,去(qù)甲基化则诱导了基因的重新(xīn)活(huó)化(huà)和表(biǎo)达。这种DNA修(xiū)饰(shì)方(fāng)在不改变基因序列前提下(xià)实现对基因表达的调控。脊椎动物(wù)DNA的甲基化状态与生长(zhǎng)发(fā)育调(diào)控密切相关,比如(rú)在肿瘤发(fā)生时,抑(yì)癌(ái)基因(yīn)CpG岛以外的CpG序列(liè)非(fēi)甲(jiǎ)基化程度(dù)增(zēng)加,CpG岛中的CpG则呈(chéng)高度甲基化状态,导致抑癌(ái)基因表达的下降。L1e红软基地(dì)

软件特点

1.甲基化特(tè)异(yì)性的PCR(Methylation-specific PCR,MSP) 用亚硫酸氢盐处理基(jī)因组DNA,所有未发(fā)生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧(mì)啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随(suí)后设计针对甲基化和非(fēi)甲基化序(xù)列的引物进行PCR。通(tōng)过电泳(yǒng)检(jiǎn)测(cè)MSP扩增产(chǎn)物,如果用针对处理(lǐ)后甲基(jī)化(huà)DNA链的引物能得到扩增片段,则说明(míng)该位点(diǎn)存在甲基化;反(fǎn)之,说明被检测(cè)的位点不存在甲基(jī)化。L1e红软(ruǎn)基(jī)地
2.亚硫酸氢盐测(cè)序法(Bisulfite sequencing PCR,BSP)   用亚硫酸氢盐处(chù)理基因(yīn)组DNA,则未发生甲基(jī)化的胞嘧啶被转(zhuǎn)化为尿嘧啶,而甲基(jī)化(huà)的胞嘧啶不变。随后设计BSP引物(wù)进行(háng)PCR,在扩增过程中尿嘧啶全部转(zhuǎn)化为胸腺嘧啶,最后对PCR产物进行(háng)测序(xù)就(jiù)可以判断CpG位点(diǎn)是否发生甲(jiǎ)基化(huà)称(chēng)为BSP-直接测(cè)序方法。将PCR产物克隆至载体后进行测(cè)序,可以提高测序成功率(lǜ),这种(zhǒng)方法称为(wéi)BSP-克隆测序(xù)法。L1e红软基(jī)地
3.高分辨率熔解曲线法(High Resolution Melting,HRM)  L1e红软基地
在非CpG岛位置设(shè)计(jì)一对(duì)针对亚硫酸氢盐(yán)修饰后的DNA双链的引物,这对(duì)引物中间的片段包(bāo)含感兴(xìng)趣的CpG岛。若这些(xiē)CpG岛发(fā)生了甲(jiǎ)基化,用亚(yà)硫酸氢盐处理后,未甲基化(huà)的胞嘧啶经PCR扩增后转变成胸(xiōng)腺嘧(mì)啶,而甲基化的胞嘧(mì)啶不变,样品(pǐn)中的GC含量(liàng)发生(shēng)改变,从而导致熔解温度的变(biàn)化。L1e红软基地

相关介绍

DNA甲基化(英(yīng)语:DNA methylation)为DNA化学修饰的一种形式,能在(zài)不改变DNA序(xù)列的前提下(xià),改变遗传表(biǎo)现。为外遗传编码(epigenetic code)的一部分,是一(yī)种外遗传(chuán)机(jī)制。DNA甲基化过程(chéng)会使甲基添(tiān)加(jiā)到DNA分(fèn)子(zǐ)上,例如在(zài)胞嘧啶环的5'碳上:这种5'方向的(de)DNA甲基化(huà)方式可见于所有脊椎动物。L1e红软(ruǎn)基地

软件截图(tú)

MethMarker(DNA甲基化检测)L1e红软基地

软件(jiàn)下载地址
MethMarker(DNA甲基化(huà)检(jiǎn)测)
软(ruǎn)件推荐
下载排行

精品软件

热门关键词

热门软件推荐