KegArray(微阵列数(shù)据(jù)分析软(ruǎn)件)是一款教(jiāo)育教学软(ruǎn)件!KegArray(微阵列(liè)数据分析软件),其它高通量检测(high-throughput screen)技术的兴起(qǐ),无(wú)疑将成(chéng)为(wéi)本世纪的主流;微阵列实验主要的优势在于(yú)能同时大量地、全面(miàn)性地侦(zhēn)测(cè)上万个基因的表达量,通(tōng)过(guò)基因(yīn)芯片,可在短时间内找出可能(néng)受疾(jí)病影响的基因,作为早期诊断的生物(wù)标记(biomarker)。
在(zài)人类基因组测序计划(huá)的(de)重要里程碑陆续完成之后,生命(mìng)科学(xué)迈入了一个(gè)前所未有(yǒu)的新时(shí)代,在(zài)人类染色体总(zǒng)长度约(yuē)三(sān)十亿个碱基对中,约含有四万(wàn)个基因,这是生物学家首(shǒu)次以这么宏观的视野来检视生命现(xiàn)象,而(ér)医药上的研究方针亦从此(cǐ)改观(guān),科学研究从此正式进入后基因组时代。
然而(ér),由于这(zhè)一类(lèi)技术的高度自(zì)动(dòng)化、规模化及微型化的(de)特性,使得他们所生成的数据量非常庞大且(qiě)数据形态比一般实验数据更加复杂,因此,传统(tǒng)统计分析方(fāng)法已经(jīng)不(bú)堪使(shǐ)用。在此同时,统计学家并未(wèi)在此重要(yào)时刻缺席,提出(chū)非常多新的统计理论和方法来(lái)分析微阵列实验数据,也(yě)广受生物学家所使(shǐ)用。
由于微阵列数据分析所(suǒ)牵涉的统计问(wèn)题层面相(xiàng)当广且深入,本文仅针对整(zhěng)个实验中所衍生的(de)统计问题加以(yǐ)介绍,并介绍(shào)其中一些新的图形(xíng)工具(jù)用(yòng)以呈现分析(xī)结果。
微阵列(liè)芯片即一(yī)般(bān)所谓的基因芯(xīn)片,也是基因组计划(huá)完成后衍生出来的产品,花费成本(běn)虽高,但效用无限,是目前所有生(shēng)物芯片中(zhōng)应用最广的,由(yóu)于近年来不断改(gǎi)进(jìn),也是最有(yǒu)成效的生(shēng)物(wù)技(jì)术(shù)。一(yī)般而言,基因(yīn)芯片是利用微处理技术,先把(bǎ)人类所有的基(jī)因分别固着在一(yī)小范围的玻璃片(glass slide)、薄膜(membrane)或者硅芯(xīn)片(piàn)上;然后,可(kě)以平行地(dì)、大量地(dì)、全面性地侦测基因组(zǔ)中mRNA的量,也就是侦测(cè)基因的调控及相(xiàng)互(hù)作用表达。
对部分功(gōng)能进(jìn)行了优化。
