CopySeq(DNA序列分析工(gōng)具)是(shì)内存的超(chāo)快(kuài)、 高效内存读取的路线很短软件,旨(zhǐ)在将对齐短(duǎn) DNA 序列 (读取) 到人类基因组的速度每小时约 2500 万(wàn)读(dú)取一个典型的工作站上的 2 千兆字节。时下互联网常用的教育(yù)教学(xué)软(ruǎn)件之一,该软件纯(chún)绿色(sè)免费无毒,请放心(xīn)使用。
1.轻松计划和(hé)模(mó)拟DNA操作。
2.可视化(huà)的ORF阅读(dú)框,和引(yǐn)物结合位点(diǎn)。
3.自动记录在克隆项目的步骤。
4.与其他研究人员共享注明的序列文件。
基于MPI(message passing interface)平台实(shí)现了(le)HMMER软件包核心程序之一(yī)Hmmpfam的(de)大规模并行计算.该(gāi)版本(běn)针对(duì)原PVM(parallel virtual machine)并行(háng)版本在并行规模扩大后,master易成为通信瓶颈的问题,对通信结构进行了(le)优(yōu)化(huà),提出(chū)了一种新的(de)三层通信结构,在序列和HMM模型(xíng)的(de)两个(gè)层次上实现了并行化(huà),并(bìng)分别提供了有效的负(fù)载平衡策(cè)略,同(tóng)时优化了I/O性能,在700多台处理机上达到95%的效率。
应用平台:WinXP,Win7,Win8,windows10,其他 。
