STORM(蛋白质分析软件),风暴(系统定制的(de)羊痘(dòu)疮数据检(jiǎn)索与管(guǎn)理)将blast、fasta、包(bāo)含了(le)和protparam的蛋白质分析(xī)结合在(zài)一个蛋白质(zhì)序列的批(pī)处理文件中。它随(suí)后以access数据库格式总结和组织输出。
更具体(tǐ)地说,风暴(bào)提取了orf预测后的蛋(dàn)白质序列,然(rán)后对每(měi)一个蛋白(bái)质进行自动分析。该(gāi)分析包括基于web的相似性(xìng)搜索(blastp和fasta )以及包含了预测和蛋白(bái)质物理化学性质的protparam计算(suàn)。然后对这些分析的原始(shǐ)产量进行分析和(hé)总结。所有(yǒu)这些步骤都(dōu)需要最少(shǎo)的用(yòng)户(hù)交互(只需点击几下鼠标(biāo)!)!!)和所有数据存储(chǔ)在Microsoft access数据库中,允许对原始输出(chū)以及此程序汇总信(xìn)息进行(háng)控制(然而,创建摘要并不严格要(yào)求访(fǎng)问数据库(kù))。该程序广泛适用(yòng)于(yú)任何一组蛋白质,但初步(bù)开发主(zhǔ)要是为了分析噬菌体基因组。
蛋白质是生命(mìng)的物(wù)质(zhì)基础,没有(yǒu)蛋白(bái)质(zhì)就没有生命。因此(cǐ),它是(shì)与生命及(jí)与(yǔ)各种形(xíng)式的生命活动紧(jǐn)密联(lián)系在(zài)一起的物质(zhì)。机体中的每一个细(xì)胞和所有重要组成部分都有蛋白质(zhì)参与(yǔ)。蛋白质占人体重量的16%~20%,即一个60kg重的成年人其体内(nèi)约有蛋白(bái)质(zhì)9.6~12kg。人体内蛋白质的种类(lèi)很(hěn)多,性质、功能各异,但都是由20多种氨(ān)基(jī)酸(suān)按不同比例组合(hé)而成(chéng)的,并在体内不断进行(háng)代谢与更新。
