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DnaSP(基因多态性分析软件)

软件类(lèi)型:
国产软件
软件(jiàn)语言:
简体中文
软件(jiàn)大小:
4 MB
软件授(shòu)权:
免(miǎn)费软件
软件评级:
4
更新时间:
2017-05-12
应(yīng)用(yòng)平台:
WinXP, Win7, WinAll
软件简介(jiè)

DnaSP(基因多(duō)态(tài)性(xìng)分析软件)是一个(gè)用于(yú)分(fèn)析序列DNA序列数据的(de)核苷酸多(duō)态性的软件包。dnasp可以估(gū)计种群内和居群间(在非编码、同义(yì)或(huò)产生的位点或各种密码(mǎ)子(zǐ)位置)的(de)DNA序列变(biàn)异(yì)的(de)几种(zhǒng)度量,以及(jí)连锁不(bú)平(píng)衡、重组、基因流动和基因转(zhuǎn)换参数。dnasp还可以进(jìn)行一些中(zhōng)性的测(cè)试:哈(hā)德逊、kreitman和aguadé ( 1987 )、日本田岛(dǎo)( 1989 )、麦当(dāng)劳和kreitman。OhP红软基地

软件介绍

DnaSP是一款专业(yè)的dnA类比分析软件,一般用于专业的医学领域,用(yòng)于(yú)研(yán)究(jiū)和学习(xí)使用(yòng),有(yǒu)相关专业的朋友(yǒu)不(bú)要错过。OhP红软(ruǎn)基(jī)地(dì)
DnaSP,DNA序列多(duō)态性,是一个软件(jiàn)包,从对齐的(de)DNA序列数(shù)据(jù)核苷(gān)酸(suān)多态(tài)性的分析。 DnaSP可以估(gū)计DNA序列(liè)变(biàn)异的内和之间的人(rén)口数(shù)的措施(在非编码,或同(tóng)义非同义位(wèi)点,或在形形(xíng)色色的密(mì)码子位置(zhì)的),以及连锁不(bú)平(píng)衡,重(chóng)组,基(jī)因流 和基(jī)因(yīn)转换参数。 DnaSP还可以进行中立的几(jǐ)个测试(shì):哈德森(sēn),Kreitman和Aguadé(1987),田岛(1989),麦当劳和Kreitman(1991), 傅和Li(1993),及富(1997)的测试。此外,DnaSP可通(tōng)过聚结估计的一些测试(shì)统计量(liàng)的置信区间。该分析的(de)结(jié)果显示在表格和图形(xíng)的形式。OhP红软基地

使用说明

1. 打开DnaSP,出现动态(tài)DNA图像,点击画面任(rèn)何一处即会(huì)静(jìng)止,再点击又呈现动(dòng)态;点file 标签,出(chū)现空白(bái)画(huà)面.OhP红软(ruǎn)基(jī)地
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2. 点file-open data file, 选择要打开的文(wén)件(FASTA, MEGA, NBRF/PIR,NEXUS and PHYLIP等格式)后,出现一个小窗口,描述了(le)所打开序列数据的总的(de)核苷酸数目,序列数(shù)目等。点close,如果想在稍(shāo)后重新打(dǎ)开(kāi)这个(gè)窗口,可以点Display-Data info.OhP红软基地
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3. Display-view data,查看对比序列.OhP红软基地
4. 计算核苷酸(suān)多态性:点Analysis-DNA polymorphism, 出现一个选(xuǎn)项卡供选择要分析序列的全长或某一区段(Region to Analyze)和运算法则(options)等;如果想知道在整个序列的哪一段多态性较高,可以在sliding window点(diǎn)中(zhōng)compute进行选择。如果只打开了一个序列,则会出现(xiàn)要(yào)求选择多(duō)个(gè)序列进行分析的提示框.OhP红软(ruǎn)基地
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5. 中性检验OhP红软基(jī)地
点击Analysis-Tajima's testOhP红(hóng)软基(jī)地
该检验的目的是鉴定目标DNA序列在(zài)进化过程中是否遵循中性进化模型。大多数由自发突(tū)变(biàn)造成的(de)分子差异不(bú)会影(yǐng)响到个体适(shì)宜度,推论指出基因进(jìn)化根(gēn)本上是通过遗传漂变来实现的。OhP红软基地

软件说明

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软件截图

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