EMBOSS快速指南文档（dàng）是一个开源的序列分析（xī）软件包，可在UNIX系统上以命令（lìng）行（háng）方式运行，目前（qián）也已经有基于X窗（chuāng）口（kǒu）系统和（hé）Web的图形界面的（de）EMBOSS。
该软件（jiàn）包（bāo）源（yuán）于1988年开（kāi）始开发的EGCG系统，整合了目前可以获（huò）得的大部（bù）分（fèn）序（xù）列分析软件，并（bìng）有（yǒu）一套专（zhuān）门设（shè）计的C语（yǔ）言库函数。
程序（xù）帮助
寻（xún）找一个程序，可以使用EMBOSS 应用程序wossname，用一个（gè）关（guān）键字对（duì）所有程序的（de）描述（shù）
进行搜索。
wossname keyword 显示在描（miáo）述信息中包含该关（guān）键字的所有程序列表
wossname -alphabetic –auto 显示所有程序
programname –help 给出该（gāi）程序的可用参数
tfm programname 显示该程（chéng）序的文档。
序列格式（shì）
序列储存（cún）在数据（jù）库内或是（shì）以纯文（wén）本存于文件内。EMBOSS不支（zhī）持Word处理的文（wén）件！缺省
的序列格（gé）式（shì）是fasta。这个格式的第一行是初始标题行包含一个“>”，其后是序列描述的，
第二行及以后的行是序列，例如（rú）：
>fau Human FAU gene fragment
GACCGGCCAGGAAACGGCATG
当前的EMBOSS 支（zhī）持（chí）42 种（zhǒng）格式，包（bāo）括Clustal， EMBL， GCG， GenBank， PIR， MSF， Phylip，
SwissProt， Text(raw)。
所（suǒ）以程序的缺省输出（chū）可以通过环（huán）境变量的设置来（lái）改变：
setenv EMBOSS_OUTFORMAT format
等（děng）用程序
embossdata 找到或取（qǔ）出用EMBOSS程序读入的数据文件
embossversion 显示出当（dāng）前（qián）EMBOSS的版本号
本文档由（yóu）英国EMBnet节点（diǎn）的Lisa Mullan设计（jì）和撰写，由EMBnet的P&PR发布委（wěi）员会（huì）发
布。
EMBnet－欧（ōu）洲分子生（shēng）物学（xué）网（wǎng）络－是一个由众多欧（ōu）洲生物（wù）信息（xī）中心组成的生物信息网络。大（dà）
多数国家都有一个（gè）国家节点，能（néng）为生物信息软件用户提供培（péi）训（xùn）课程（chéng）和其（qí）他形式的（de）帮助。
你能从（cóng）EMBnet站点发现关于你的国（guó）家节点的信息：
[url]http://www.embnet.org/[/url]
EMBOSS快捷指（zhǐ）南。
对部分功能进（jìn）行了优化。
