轻（qīng）松学用生物软件是（shì）一个多平（píng）台开源软件（jiàn），主要目（mù）的是协（xié）助缺乏生物信息（xī）学经（jīng）验的分子生物学家（jiā）管理、分析和可视化他们（men）的数据。UGENE在一个常见（jiàn）用户界面中整合了广泛使用（yòng）的（de）生（shēng）物信息学工具。该工具包支持多种生（shēng）物学数据格式，并允许从远程数（shù）据来源检索数据。cqd红（hóng）软基地

软件功能

它提供了生（shēng）物学对（duì）象（例如带注释的（de）基因组序列、下一代测序（Next Generation Sequencing，NGS）装配数（shù）据，多重序列比对（duì），系统（tǒng）发生（shēng）树和三维结构）的可视化（huà）模块。大部分整合的算法被调整以通过（guò）使（shǐ）用（yòng）多线（xiàn）程和专（zhuān）用处理器指令发挥（huī）最大性能。UGENE包括一个可（kě）视化环境以创建（jiàn）能够在本地资（zī）源或在（zài）一（yī）个高性能计算（High Performance Computing，HPC）环境中启（qǐ）动的可重用流程。UGENE使用Qt框架以C++编（biān）写（xiě）。内置的插件系统和结构化UGENE API使得可以（yǐ）用新的功能（néng）扩展该工具包。cqd红软基地

软件特色

unipro是一个多平台开源软件，其主要目标（biāo）是帮助分（fèn）子生物学（xué）家在（zài）生物（wù）信息（xī）学中没有太（tài）多的（de）专业（yè）知识来（lái）管（guǎn）理（lǐ）、分析和可视（shì）化他们的数据。ugene集成了广泛（fàn）使用（yòng）的生物（wù）信息学工具在一个通用的用户界面中。该工具（jù）包支持多种生（shēng）物数据格（gé）式，允许（xǔ）从远程数据源检索数据。它提（tí）供了生（shēng）物（wù）对象的可视化模块（kuài），如（rú）注释的基因组序（xù）列、新一代测（cè）序汇（huì）编数据（jù）。cqd红软基地

软件说明

1、基因芯片（piàn）综合分析软件。 cqd红软基地
ArrayVision 7.0 一种功能强大的商业版基因芯（xīn）片（piàn）分析软件，不仅可以进行图像分析，还（hái）可（kě）以（yǐ）进（jìn）行数据处理，方便protocol的管理功（gōng）能（néng）强（qiáng）大，商业版正式版：6900美元。 cqd红软基（jī）地
Arraypro 4.0 Media Cybernetics公司的（de）产品，该（gāi）公司的gelpro， imagepro一直以精确成为（wéi）同类产品中（zhōng）的佼佼（jiǎo）者，相（xiàng）信arraypro也不（bú）会差。 cqd红软基（jī）地
phoretix™ Array Nonlinear Dynamics公（gōng）司的基因片综合分析软件。 cqd红软基（jī）地
J-express 挪（nuó）威Bergen大学编写，是一（yī）个用JAVA语（yǔ）言写的应用程序，界面清（qīng）晰漂亮，用来分（fèn）析微（wēi）矩（jǔ）阵（zhèn）（microarray）实验获得的基因表达（dá）数据，需要下载（zǎi）安装JAVA运（yùn）行环境JRE1.2后(5.1M)后，才能运（yùn）行（háng）。cqd红软（ruǎn）基（jī）地
2、 基因芯片阅（yuè）读图像分析软件cqd红软基地
ScanAlyze 2.44 ，斯坦福（fú）的（de）基（jī）因芯片基因芯（xīn）片阅读软件，进行（háng）微（wēi）矩阵荧（yíng）光图像分（fèn）析，包括（kuò）半自动定义格栅与（yǔ）像素点（diǎn）分（fèn）析（xī）。输出为分隔的文（wén）本格式，可（kě）很容易地转化（huà）为任何数据库。cqd红软基地
3、 基因（yīn）芯片数（shù）据分析软件cqd红软基地
Cluster 斯坦福的（de）对大量微矩阵数据组进行各（gè）种簇（Cluster）分析与其它各种处理（lǐ）的软件。 cqd红软基（jī）地
SAM Significance Analysis of Microarrays 的（de）缩（suō）写，微矩阵显著（zhe）性分（fèn）析软件，EXCEL软件的插件（jiàn），由Stanford大学编（biān）制。cqd红软基地（dì）
4．基因芯片聚类图形显示 cqd红（hóng）软基地
TreeView 1.5 斯坦福开发的（de）用来显示（shì）Cluster软件分（fèn）析的图（tú）形化结果。现已和（hé）Cluster成为了基（jī）因芯（xīn）片处理的标准软件。 cqd红（hóng）软（ruǎn）基地
Freeview 是基（jī）于JAVA语言的（de）系（xì）统树生成软件，接收Cluster生（shēng）成的（de）数（shù）据，比Treeview增强了某些功能。cqd红软基（jī）地
5．基因芯片引物设计（jì）cqd红软（ruǎn）基地（dì）
Array Designer 2.00 DNA微矩阵（microarray）软件（jiàn），批（pī）量设计DNA和寡核（hé）苷酸引物工具（jù）。cqd红软基地

软（ruǎn）件截图

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