MOIL(免费分子模型建模软件)，免（miǎn）费三维分子模型建模软件。Z4j红（hóng）软基地

软件介（jiè）绍（shào）

MOIL(免费分子（zǐ）模型建模软件（jiàn）)是一款功（gōng）能强大的，易于使用的 FBLD（Fragment Based Lead Discovery 基于分子片段的药物研究）与 SBDD（structure-baseddrugdesign，基于结构的药物设计）平台。Z4j红（hóng）软基地（dì）

软件功能（néng）

1、能量最小计算：能（néng）量最小化计（jì）算考察分子的稳定结构，或（huò）通（tōng）过软（ruǎn）件提供的（de）MOPAC、Jaguar， GANESS及Gaussian的接（jiē）口，进（jìn）行（háng）从头计算或半（bàn）经验计（jì）算，甚至（zhì）NMR，IR或Raman光（guāng）谱的预（yù）测（cè），其中MM2-对分子（zǐ）进（jìn）行初步的能量最小化计算，MOPAC-半经验算（suàn）法（fǎ）， MMFF94-12.0版本新（xīn）增加力场（chǎng），而GAMESS、 Jaguar好（hǎo）Gaussian-从头计算。Z4j红软基地（dì）
2、ChemBio3D能够计算（suàn）分子更多的（de）物化性（xìng）质，以平面进行旋转，计算能量最小构造，以下（xià）图为（wéi）例，图（tú）A是最低（dī）能量（liàng）构造侧视图，图B是最低（dī）能量构（gòu）造俯视图，图C是分子所（suǒ）在两个平面的夹角（jiǎo）对能量的影响。Z4j红软（ruǎn）基地
三种能量（liàng）最小构造Z4j红（hóng）软（ruǎn）基地（dì）
3、物（wù）化性质计算：ChemBio3D可计算（suàn）分子更多的（de）物化性质（zhì）。ChemProp Pro包括（kuò）固有变量计（jì）算（suàn），如（rú）沸（fèi）点、临界压力、温度和体积、亨利定律（lǜ）常数、熔点、蒸（zhēng）汽压和水溶性（xìng）等。ChemPro Std包括（kuò）形式（shì）电荷、几个Connolly变（biàn）量、准确质量（liàng）、椭圆度等（děng）。CLogP Driver能够计算提供摩尔折射率（lǜ）和分（fèn）配系数，支持GAMESS程序接口、Jaguar程序（xù）接口、MOPAC程序（xù）接口。另外，Molecular Topology可用于（yú）测量分（fèn）子拓扑学的诸多方面（miàn），包括（kuò）Balaban指数、Cluster Count、一些旋转键、形状系数、拓扑直径（jìng）和（hé）其它参（cān）数等。Z4j红软（ruǎn）基地

软件特色

　　1、该分（fèn）子模（mó）型软件支（zhī）持生（shēng）成分子坐标（PDB格式）； Z4j红软基地
　　2、支持设定电子密（mì）度； Z4j红（hóng）软基（jī）地
　　2、支持MSMS表（biǎo）面数据； Z4j红软基（jī）地
　　3、支（zhī）持（chí）apbs静电势图。Z4j红（hóng）软基地

软件（jiàn）截图（tú）

 Z4j红软基地（dì）